Establece la conformación de tres comités para el funcionamiento del sistema: 1. Comité Estratégico: Es el espacio encargado de orientar y proveer los lineamientos del Sistema, 2. Comité Programático: Es el espacio de orientación y coordinación técnica con entidades nacionales y territoriales en materia de cooperación internacional y 3. Comité Operativo: Está constituida por los espacios sectoriales o territoriales en los que se coordina la implementación de los planes de trabajo de cooperación internacional y se realiza su seguimiento.